การอนุรักษ์น้ำและการใช้ทรัพยากรอย่างมีประสิทธิภาพ
ประเภทต่างๆ ของเรือนกระจกแสดงให้เห็นถึงประสิทธิภาพในการใช้ทรัพยากรอย่างโดดเด่น ซึ่งช่วยแก้ไขปัญหาสิ่งแวดล้อมที่สำคัญอย่างยิ่ง ขณะเดียวกันก็ลดต้นทุนการดำเนินงานลงอย่างมาก การอนุรักษ์น้ำถือเป็นหนึ่งในข้อได้เปรียบที่สำคัญที่สุดของการเพาะปลูกในเรือนกระจก โดยระบบที่ปิดสนิทสามารถประหยัดน้ำได้สูงถึง 90% เมื่อเทียบกับการเกษตรแบบไร่นาแบบดั้งเดิม ความประหยัดน้ำที่โดดเด่นนี้เกิดขึ้นผ่านกลไกหลายประการ รวมถึงการลดการระเหย การควบคุมระบบให้น้ำอย่างแม่นยำ และความสามารถในการนำน้ำกลับมาใช้ใหม่ ซึ่งช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการใช้น้ำทุกหยดให้สูงสุด เรือนกระจกแบบกระจกมีจุดเด่นด้านการจัดการน้ำ เนื่องจากสามารถจับและนำน้ำควบแน่นกลับมาใช้ใหม่ได้โดยธรรมชาติ ทำให้เกิดระบบที่ปิดสนิท (closed-loop systems) ซึ่งลดการสูญเสียน้ำให้น้อยที่สุด ขณะเดียวกันก็รักษาความชื้นสัมพัทธ์ในระดับที่เหมาะสมที่สุดสำหรับการเจริญเติบโตของพืช สภาพแวดล้อมที่ควบคุมได้ช่วยป้องกันการสูญเสียน้ำจากการระเหยโดยลม และยังทำให้สามารถให้น้ำได้ตรงตามเวลาที่พืชต้องการดูดซึมอย่างแม่นยำที่สุด เรือนกระจกแบบโพลีคาร์บอเนตส่งเสริมประสิทธิภาพการใช้น้ำผ่านสมบัติการฉนวนความร้อนที่เหนือกว่า ซึ่งช่วยลดการสูญเสียน้ำควบแน่น ขณะเดียวกันก็รักษาความชื้นสัมพัทธ์ให้คงที่ เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการใช้น้ำของพืชให้สูงสุด ลักษณะการปิดสนิทของเรือนกระจกแต่ละประเภทเหล่านี้ยังเอื้อต่อการนำเทคโนโลยีการให้น้ำขั้นสูงมาใช้งาน เช่น ระบบให้น้ำแบบหยด (drip systems), ระบบฝอยฝนขนาดเล็ก (micro-sprinklers) และวิธีการปลูกแบบไฮโดรโปนิกส์ (hydroponic methods) ซึ่งสามารถส่งน้ำและธาตุอาหารไปยังบริเวณรากของพืชโดยตรง พร้อมลดการสูญเสียให้น้อยที่สุด ระบบควบคุมการให้น้ำอัตโนมัติที่ผสานเข้ากับเซ็นเซอร์วัดความชื้นในดิน จะทำให้พืชได้รับปริมาณน้ำที่เหมาะสมที่สุด และป้องกันไม่ให้รดน้ำมากเกินไป ซึ่งอาจนำไปสู่โรคของรากและการชะล้างธาตุอาหารออกจากดิน เรือนกระจกแบบฟิล์มพอลิเอทิลีน (polyethylene film greenhouses) ให้ผลการอนุรักษ์น้ำที่คุ้มค่าสำหรับการดำเนินงานในขนาดใหญ่ เนื่องจากสามารถเก็บกักน้ำฝนและป้องกันการกัดเซาะของดิน ขณะเดียวกันก็รักษาสภาพแวดล้อมการเพาะปลูกที่ควบคุมได้ ประสิทธิภาพในการใช้ทรัพยากรไม่จำกัดอยู่เพียงแค่การอนุรักษ์น้ำเท่านั้น แต่ยังขยายไปถึงการจัดการปุ๋ยด้วย โดยสภาพแวดล้อมที่ควบคุมได้ช่วยให้สามารถใส่ธาตุอาหารได้อย่างแม่นยำ ลดการไหลบ่าของสารเคมีและมลพิษต่อสิ่งแวดล้อม ระบบไฮโดรโปนิกส์และระบบอะควาโปนิกส์แบบปิดสนิท (closed-loop hydroponic and aquaponic systems) ที่สามารถสร้างขึ้นภายในสภาพแวดล้อมของเรือนกระจกนั้น สามารถนำธาตุอาหารกลับมาใช้ซ้ำได้อย่างต่อเนื่อง ขณะเดียวกันก็ผลิตทั้งพืชและโปรตีนจากปลาได้อย่างมีประสิทธิภาพ อีกหนึ่งข้อได้เปรียบสำคัญด้านทรัพยากรคือประสิทธิภาพการใช้พลังงาน โดยการออกแบบเรือนกระจกสมัยใหม่ได้ผสานระบบพลังงานหมุนเวียน เทคโนโลยีการกู้คืนความร้อน และระบบควบคุมภูมิอากาศอัจฉริยะ (smart climate control systems) ซึ่งช่วยลดการใช้เชื้อเพลิงฟอสซิลให้น้อยที่สุด ขณะยังคงรักษาเงื่อนไขการเพาะปลูกที่เหมาะสมตลอดทั้งปี